Третий сезон Последнего корабля начинается в тот момент, когда экипаж эсминца Натан Джеймс уже стал последней надеждой человечества. Вирус, который уничтожил большую часть мира, больше не самая страшная угроза. Люди научились выживать рядом с ним, но теперь появились те, кто хочет использовать вирус и лекарство от него как оружие.

Команда наконец нашла способ распространять лекарство по всей планете. Казалось бы, победа близко. Но всё меняется, когда на корабль нападают пираты и отбирают почти всё ценное оборудование. Экипаж остаётся практически без средств, чтобы продолжать миссию.

Капитан Ченг и его люди отправляются в опасное путешествие по Азии. Им нужно найти новый способ производить лекарство в огромных количествах. По пути они встречают разных людей. Кто-то готов помогать, кто-то видит в лекарстве только возможность заработать или захватить власть.

В этом сезоне появляется новая угроза. Некоторые выжившие научились контролировать заражённых и используют их как армию. Теперь противостоять приходится не только болезни, но и тем, кто готов уничтожить остатки цивилизации ради своих целей.

Команда разрывается между желанием спасти как можно больше людей и необходимостью защищать себя. Каждое принятое решение стоит очень дорого. Иногда приходится выбирать, кого спасать, а кого оставить.

Экипаж посещает разрушенные города, заброшенные военные базы и даже попадает на плавучую тюрьму. Везде их ждут новые испытания. Доверие между людьми становится роскошью, которую мало кто может себе позволить.

Том Чендлер всё больше ощущает груз ответственности. Он понимает, что спасение человечества может потребовать от него поступков, которые раньше казались недопустимыми. Команда меняется, некоторые герои уходят навсегда, появляются новые лица.

Зрителей ждут морские сражения, перестрелки на суше, неожиданные союзы и предательства. Напряжение растёт с каждой серией. Становится ясно, что вирус был только началом, а настоящая борьба за будущее только начинается.

Третий сезон показывает, как далеко могут зайти люди, когда на кону выживание всего вида. Здесь нет простых ответов и лёгких решений. Есть только выбор, который приходится делать каждый день.

В итоге экипаж Натана Джеймса доказывает, что даже в самом тёмном мире остаётся место надежде. Главное - не терять друг друга и помнить, ради чего всё это началось.