Действие сериала Психо-Паспорт происходит в Японии 2112 года. В этом мире люди больше не судят друг друга по поступкам. Всё решает специальная система Сибила. Она сканирует мозг каждого человека и мгновенно определяет, насколько он психически здоров и склонен ли к преступлениям.

Этот показатель называют коэффициентом преступности. Если он низкий и цвет психода чистый, человек свободен. Если коэффициент растёт и психод мутнеет, гражданина отправляют на принудительное лечение. А если становится совсем плохо, его могут уничтожить на месте.

За такими людьми следят особые отряды Бюро общественной безопасности. В каждом отряде два типа сотрудников. Инспекторы - это те, у кого коэффициент всегда в норме. Они принимают решения и дают команды. А исполнители, которых называют псами, - это латентные преступники. Их коэффициент уже испорчен, но система позволяет им работать, пока они под контролем.

Главное оружие в руках сотрудников - специальный пистолет Доминатор. Он сам сканирует цель и решает, можно ли стрелять. Если коэффициент преступности низкий, оружие просто не выстрелит. Если высокий, Доминатор может парализовать человека или уничтожить его полностью.

В центре истории молодая инспектор Аканэ Цунэмори. Она только что закончила академию с лучшими результатами и полна веры в систему Сибила. Её назначают в отряд, где работает опытный исполнитель Синья Когами.

Когами когда-то сам был инспектором, но после одного страшного дела его коэффициент резко ухудшился. Теперь он охотится на преступников, которых обычная полиция не может достать. Он умён, силён и почти не говорит о прошлом.

Поначалу Аканэ трудно принять жёсткие методы Когами. Она хочет верить, что система справедлива и каждого можно спасти. Но с каждым новым делом девушка видит всё больше трещин в идеальном мире.

Вместе они расследуют сложные преступления. Иногда преступники оказываются умнее системы и находят способы обмануть Сибила. Иногда жертвы сами провоцируют насилие, потому что не выдерживают жизни под постоянным контролем.

Город выглядит чистым и безопасным. Улицы светлые, люди вежливые, преступность почти исчезла. Но за этой красотой скрывается страх. Люди боятся думать не так, чувствовать слишком сильно, выделяться.

Аканэ постепенно меняется. Она начинает задавать вопросы, на которые система не хочет отвечать. Кто решает, что нормально, а что нет? Может ли машина по-настоящему понять человеческую душу?

Когами же идёт своим путём. У него есть личная цель - найти человека, который когда-то разрушил его жизнь. Он готов переступить любые правила ради правды.

Сезон показывает, как два разных человека ищут справедливость в мире, где справедливость давно заменили цифрами. Один пытается сохранить веру в систему. Другой давно понял, что иногда нужно стать преступником, чтобы защитить людей.

Зрителю остаётся только следить за их выбором и думать: а так ли идеально будущее, в котором нас всех постоянно сканируют и оценивают.